♦ Espèce définie comme une catégorie cible spécifique. Elle est choisie pour des projets de restauration ou de conservation car elle est très sensible aux impacts humains, a des besoins d'habitats qui sont supposés englober ceux de nombreuses autres espèces, fournit des services écologiques ou aide à développer le soutien du public. Une espèce focale répond à au moins un des critères suivants :

• Grande demande d'espace, avec une large distribution
• Concentration saisonnière ou quotidienne des populations
• Capacité de dispersion limitée
• Faible reproduction ou fécondité
• Grande taille ou plus grand membre dans la guilde alimentaire
• Alimentation et besoins en habitats spécialisés
• Spécialisation reproductive
• Dépendance pour des habitats rares ou largement dispersés
• Sensibilité au climat
• Population peu importante en nombre d'individus ou en déclin
• Métapopulations avec des compositions génétiques uniques
• Facteurs liés à l'Humain :
  - Habitat menacé par la perte, la conversion, la dégradation ou la fragmentation
  - Population menacée par l'exploitation directe, le harcèlement ou les interactions écologiques.

♦ Équivalent étranger : Focal species, target species.

♦ Métaphore qui désigne une espèce animale ou végétale si abondante localement qu’elle constitue, pour d’autres espèces, une ressource alimentaire importante (comme le sont les plantes fourragères). Les pucerons dont les colonies recouvrent complétement les tiges de leurs plantes-hôtes sont par exemple considérés comme des espèces fourrages, de même que les prairies sous-marines équivalent océanique des prairies terrestres ou que le phytoplancton très largement consommé par le zooplancton.
♦ Équivalent étranger : Fodder species.

♦ Espèce disposant d'une niche écologique très large, qui peut tolérer une grande variété de conditions environnementales et dont le régime alimentaire comprend une large gamme de ressources.
♦ Équivalent étranger : Generalist species.

♦ Espèce susceptible d’héberger et de laisser se développer, à ses dépens, un pathogène.
♦ Équivalent étranger : Host species.

♦ Qui vit en permanence dans l'eau (espèce aquatique).
♦ Équivalent étranger : Hydrophile species.

♦ Qui ne peut vivre que dans des milieux très humides souvent saturés ou proches de la saturation.
♦ Équivalent étranger : Hygrophile species.

♦ Espèce qui a été enregistrée dans une aire géographique donnée mais dont la présence n’a été confirmée ni par une photographie ni par la collecte d’un spécimen. Cette définition concerne essentiellement les espèces nouvelles ou les espèces dont l’occurrence dans une région déterminée n’a pas encore été mise en évidence.
♦ Équivalent étranger : Hypothetical species.

♦ L’identification des espèces indicatrices, ou espèces caractéristiques, est une opération classique en écologie et en biogéographie. Les études décrivant des types d’habitat mentionnent habituellement une ou plusieurs espèces caractérisant chaque type. Les suivis environnementaux de même que les recherches visant la conservation des espèces ou l’aménagement d’un territoire ont souvent recours à l’identification d’espèces indicatrices (bioindicateurs). Parce que les espèces indicatrices donnent un sens écologique à une typologie de sites, elles fournissent des critères pour (a) comparer des typologies différentes obtenues par analyse des données (groupement) et (b) identifier les niveaux intéressants dans un dendrogramme.

On peut distinguer :

• Les espèces sensibles, dominant largement le peuplement en conditions normales ;
• Les espèces tolérantes, parmi lesquelles certaines ne fluctuent pas de façon significative dans des conditions anormales, et d'autres prolifèrent lorsqu'il y a une perturbation ;
• Les espèces opportunistes, supportant aisément des conditions de perturbation extrêmes.

> Les populations d'espèces sont dans un état de flux dû aux impacts cumulés et interactifs du changement climatique et des facteurs humains sur les paysages et de ce fait sont communément utilisées comme indicateurs écologiques. Plusieurs raisons expliquent pourquoi les espèces sont souvent utilisées comme indicateurs dans la conservation : 

• Les espèces constituent l'indicateur le plus anciennement utilisé dans la gestion écologique/biologique ; 
• La légitimité des espèces comme indicateurs des écosystèmes a créé un ensemble de données à long terme ; 
• Les espèces sont fortement liées aux systèmes de gestion humains et ont une importance socio-économique ; 
• Les espèces doivent être des espèces ombrelles.

♦ Équivalent étranger : Indicator species.

♦ Une espèce, une sous-espèce ou un taxon inférieur, présent dans son aire de répartition naturelle (passée ou présente) ou de dispersion potentielle (c'est-à-dire dans l'aire de répartition occupée naturellement ou pouvant être occupée sans introduction directe ou indirecte ou intervention de l'homme.)

♦ Fait référence à une espèce qui vit dans le nid d’une autre et profite de l’abri et des éventuelles réserves. Exemple des abeilles qui parasitent des nids déjà approvisionnés en pollen, dont les larves volent les réserves à la larve locale.
♦ Équivalent étranger : Inquilin species.

♦ Toute espèce transportée et relâchée, intentionnellement ou accidentellement, par l'Homme dans un environnement où elle n'était jusqu'ici pas présente.

• Plante introduite intentionnellement
  Se dit d’une plante indigène ou non indigène prélevée par l’Humain d’un endroit où elle croissait spontanément, et plantée ou semée volontairement dans un espace naturel ou seminaturel à des fins d’ornement, de bornage, ou comme curiosité… Les plantes introduites intentionnellement peuvent, au bout de 10 ans d’observation dans une même station sans intervention de l’Humain, se naturaliser. D’autres restent liées à un entretien par l’Humain des lieux où elles poussent.
• Plante introduite accidentellement
  Se dit d’une plante non indigène poussant spontanément, arrivée fortuitement sur le territoire considéré par l’activité humaine (voies de communication telles que réseaux ferroviaire, routier, portuaire maritime ou fluvial, ou transport et dépôt de matériaux dans friches urbaines, industrielles ou cimetières). Les plantes introduites accidentellement peuvent, au bout de 10 ans d’observation dans une même station sans intervention de l’Humain, se naturaliser.

♦ Équivalent étranger : Introducted species.

♦ Espèce non indigène, introduite accidentellement ou délibérément hors de son aire de distribution, qui affecte négativement des habitats et des biorégions sur les plans écologique, environnemental et économique. Elle peut constituer une grave menace pour la biodiversité en contribuant à éliminer des espèces locales qui peuvent s'avérer moins compétitives. Elle se développe d'autant mieux si elle trouve une niche écologique vacante et si aucun prédateur local n'est adapté à son contrôle. Elle crée des perturbations en dominant une région, une aire protégée, des habitats particuliers et/ou des interfaces entre des zones urbaines ou naturelles en raison de pertes de contrôle de ces espèces.
Une invasion tend à banaliser les communautés car les espèces dotées de caractères efficaces pour conquérir de nouveaux espaces et s’y multiplier au détriment d’espèces natives deviennent facilement cosmopolites et compétitivement supérieures à celles dont elles prennent la place.
Nombre d’entre elles ont des effets fâcheux sur la structure et le fonctionnement des écosystèmes, ainsi que sur l’agriculture, le pastoralisme, et d’autres services écosystémiques, sans parler des problèmes de santé qu’elles peuvent soulever quand elles sont les vecteurs d’agents pathogènes.
Les problèmes soulevés par ces espèces peuvent se compliquer quand elles profitent à certaines composantes des communautés tandis qu’elles ont des effets désastreux sur d’autres.
Une espèce invasive n'est pas obligatoirement envahissante dans son aire de répartition d'origine car elle y est soumise à un équilibre lié aux autres espèces, aux consommateurs ou aux prédateurs. Elle peut par ailleurs avoir des conséquences économiques et/ou sanitaires négatives.
♦ Équivalent étranger : Invasive species.

♦ Définit une espèce qui requiert une matrice aqueuse dans des habitats strictement terrestres pour pouvoir subsister.
♦ Équivalent étranger : Limno-terrestrial species.

♦ Espèce captive ou domestique qui retourne à l'état sauvage. La pression de sélection pour la domestication disparaît lorsqu'une population devient marronne.

> Le terme « marron » est issu de l’espagnol « cimarron » (élevé, montagnard). Il était utilisé par des colons antillais pour désigner un « esclave nègre fugitif », par assimilation aux animaux domestiques devenus sauvages après s’être enfuis dans les montagnes. L’anglicisme « féral » est également utilisé pour désigner ces animaux (Cugnasse, 2023).

♦ Équivalent étranger : Feral species.

♦ Espèce adaptée aux températures élevées (dite aussi sténotherme chaude ou thermophile).
♦ Équivalent étranger : Megatherm species.